Добрый день, считаю, что при торговле через интернет, нужно платить торговый сбор или нет, зависит от того, как клиент получает товар. Если интернет-магазин сам доставляет товар со своего склада, в том числе с помощью курьера, почты, торговый сбор не уплачивается. Если же интернет-магазин непосредственно торгует через склад или свой пункт самовывоза, где клиент может расплатиться за товар, как в обычном магазине, то придется платить сбор. Если клиент делает только самовывоз со склада, но не расплачивается, объекта обложения тоже не возникает.
Даже в том письме, которое вы приводите сказано: «Ведение деятельности через интернет-магазин с пунктом самовывоза, который не отвечает признакам торгового объекта, в котором покупатель забирает свой товар, не облагается торговым сбором». Про оплату не написано.