Ирина 007, указание № и даты п/п в счёт-фактуре на реализацию лишним не будет.
Напротив, если между предоплатой и реализацией есть временной разрыв, попадающий в разные отчётные периоды (хотя это не Ваш случай), проще будет подтвердить обоснованность вычета НДС с ранее начисленного аванса по этому платежу.