Порядком № 925н предусмотрены разные формы первичного ЛН и продолжения его.
Как после бумажного ЛН можно получить продолжение в электронном виде, так и наоборот.
Электронный ЛН может быть выдан лишь в случае предоставления СНИЛС, в то время как для бумажного достаточно паспорта. Возможно, в "родном посёлке" сотрудница СНИЛС не предоставила.
А так - ситуация вполне штатная. Считайте и оплачивайте как обычно.