Ирина Sokol, вы можете вести бизнес по всем ОКВЭДам, отраженным в ЕГРЮЛ вашего ИП. И систему налогообложения вы выбираете самостоятельно. Да, вы можете работать в одном магазине по рознице и опту одновременно. Посчитайте, возможно розницу выгоднее перевести на патент. Но, вполне допустимо работать и на УСН.
Если патент выгоднее, то до 17 декабря нужно подать заявление в налоговую. Если выгоднее УСН, то никаких действий с вашей стороны не требуется, ведь вы уже являетесь плательщиком УСН. А упрощенка может применяться ко всем видам деятельности организации или ИП.