Добрый день.
Если по условиям договоров вы осуществляете доставку товара своим покупателям, то эти расходы на доставку - это косвенные расходы, полностью относятся на сч.44 и включаются в расходы в полной сумме. Доп.расходами на приобретение вами товара они быть не могут.
Расходы на доставку товара от поставщика до вашего склада - прямые расходы. Порядок их учета - элемент учетной политики. Их можно либо включать в себестоимость товара (как это делаете вы), либо учитывать на сч.44 и в конце месяца делать их распределение на остаток товара.