Добавлю свои "пять копеек" из практики.
Мы работали с компанией, которая нам оказывала брокерские услуги (услуги электронного декларирования и прочее). При этом, кроме своих актов, нам поступал от них и отчёт агента с услугами СВХ (коих они сами не оказывали) с выделением своего вознаграждения. К этому акту прилагалось две счёт-фактуры: от лица брокеров (на вознаграждение) и от лица терминала (на услуги СВХ). Расчёты велись только с брокерами.
Во избежание того, чтобы счёт-фактура на услуги СВХ не попала в книгу покупок с продавцом "БРОКЕР", а попала с реквизитами продавца, пришлось завести 2 договора с брокером - прямой (с поставщиком) и агентский (на закупку). В этом случае создаётся документ "поступление товаров, услуг, комиссия", где и делится услуга и вознаграждение, при этом регистрируются обе сяёт-фактуры, на услуги СВХ - один в один как на бумаге: продавец - тот, кто продал, а внизу приписка,что счёт-фактура составлен комиссионетом (брокером).
Взаиморасчёты по сч. 60 при этом "трогаются" только с брокером, ибо лишь он участвует в расчётах.
Рассказала на примере 1С БП 8.3