Тогда наличие или отсуствие договора не имеет значения, вы указываете налог к уплате в заявительном порядке. Никаких ограничений в зависимости от наличия или отсустивя трудового договора в части применения вычетов в НК РФ не устанолено. Гланвое условие, чтобы был доход, облагаемый по ставке 13%.
Согласно п.4 ст. 218:
"4. В случае, если в течение налогового периода стандартные налоговые вычеты налогоплательщику не предоставлялись или были предоставлены в меньшем размере, чем предусмотрено настоящей статьей, то по окончании налогового периода на основании налоговой декларации и документов, подтверждающих право на такие вычеты, налоговым органом производится перерасчет налоговой базы с учетом предоставления стандартных налоговых вычетов в размерах, предусмотренных настоящей статьей."
Это именно Ваш случай. Не вижу препятствий для получения Вами вычетов. Проблемы могут быть у работодателя, который Вас официально не оформляет.