А подписывали? Через Госулуги?
Самое первое, что приходит на ум, какой-то глюк на сайте ФНС (тоже через него приходилось отправлять, тоже не с первого раза получилось и не по моей вине).
Если декларация не принята, попробуйте заполнить с самого начала еще раз, учитывая следующее:
- данные по доходам и НДФЛ, по которым источник (например, ваш работодатель) подает отчетность в ФНС, в системе и в формируемой через нее декларации уже есть. Вы вносите только то, что декларируете. Например, вы подаете 3-НДФЛ в связи с продажей дорого имущества, и тогда только эти сведения добавляете в декларацию;
- если вносите организацию - вносите ее через ИНН. Официальное название организации и должности руководителя по ЕГРЮЛ могут отличаться от известных вам;
- свои данные тоже вносите внимательно.