какой код дохода используют при начислении денежной премии к грамоте?

Смотря как Вы оформите это премию к грамоте в приказе по предприятию. В целом премии облагаются НДФЛ, для них предусмотрено два кода доходов в целях исчисления НДФЛ:

1. 2002 - Суммы премий, выплачиваемых за производственные результаты и иные подобные показатели, предусмотренные нормами законодательства Российской Федерации, трудовыми договорами (контрактами) и (или) коллективными договорами (выплачиваемые не за счет средств прибыли организации, не за счет средств специального назначения или целевых поступлений);
2. 2003 - Суммы вознаграждений, выплачиваемых за счет средств прибыли организации, средств специального назначения или целевых поступлений.

Но есть вариант оформления по п. 28 ст. 217 НК РФ (в качестве подарка, матпомощи), тогда до 4000 руб. такая выплата налогом облагаться не будет.