Как заплатить меньше налогов при продаже участка с домом?

Да второй вариант возможен на основании пп. 3 п. 1 ст. 220 НК РФ. Но там приведен четкий перечень расходов на строительство:

• расходы на разработку проектной и сметной документации;
• расходы на приобретение строительных и отделочных материалов;
• расходы на приобретение жилого дома или доли (долей) в нем, в том числе не оконченного строительством;
• расходы, связанные с работами или услугами по строительству (достройке жилого дома или доли (долей) в нем, не оконченного строительством) и отделке;
• расходы на подключение к сетям электро-, водо- и газоснабжения и канализации или создание автономных источников электро-, водо- и газоснабжения и канализации.

Перчень закрыт и в расходы можно принять только строго поименованные в НК РФ. Для получения вычета нужно сдать декларацию 3-НДФЛ с подтверждающими расходы и продажу дома документами.