Если поставщик возмещает вам затраты на утилизацию товаров, которые не были вами реализованы до истечения срока годности, с компенсации нужно начислить НДС. Операции по уничтожению продукции по истечении срока ее годности, осуществляемые покупателями за счет средств поставщика, Минфин считает выполнением работ, НДС с которых нужно платить в общем порядке (письмо от 31.07.2017 № 03-07-11/48494).