С денег, полученных в счет возмещения ущерба имуществу, уплачивать НДС не нужно. Эти суммы не связаны с реализацией, поэтому в базу по налогу не включаются. На это указывал Минфин в письмах от 22.02.2018 № 03-07-11/11149, от 27.10.2017 № 03-07-11/70530).
Аналогичные правила применяются при возмещении убытков в виде упущенной выгоды. Их также не нужно облагать НДС (см. постановление ФАС Московского округа от 04.07.2013 № А40-123538/12-140-783 (оставлено в силе Определением ВАС РФ от 12.09.2013 № ВАС-12148/13)).
См. также: «Облагаются ли НДС суммы штрафов и неустоек по договорам?».