Если у вас есть обособленные подразделения, которые не наделены полномочиями по начислению зарплаты, то отчетность по НДФЛ нужно сдавать по месту нахождения этого подразделения, а по страховым взносам – по месту нахождения головной организации.
На это обращает внимание ФНС в Письме от 14.02.2017 № БС-4-11/2748@.
Если несколько обособленных подразделений зарегистрировано в одном муниципальном образовании, то для подачи расчета 6-НДФЛ можно выбрать одно ответственное подразделение и все расчеты подавать в налоговую, к которой относится ответственное обособленное подразделение. Для этого необходимо подать уведомление о выборе налогового органа. Изменить ответственное подразделение в течение года нельзя.
Образец заполнения уведомления о выборе налогового органа приведен в КонсультантПлюс. Оформите пробный доступ к системе и переходите в Типовую ситуацию. Это бесплатно.
Если вы решите наделить обособленное подразделение полномочиями по выплате заработной платы, то посмотрите наш материал «По какой форме сообщить о наделении подразделения полномочиями по уплате взносов?».