Вычет можно заявлять.
Если в силу технологических особенностей управления бизнес-процессами продавца экземпляры счетов-фактур подписываются разными лицами, уполномоченными на это приказом или доверенностью, оснований для отказа в вычете НДС покупателю нет. Это следует из письма Минфина от 27.06.2017 № 03-07-05/40316.
Какие ошибки в заполнении счета-фактуры не критичны для вычета НДС, читайте здесь.