Если доля в праве собственности на квартиру была продана как самостоятельный объект купли-продажи, вычет можете заявить в максимальном размере – 1 000 000 руб. (письмо Минфина от 30.05.2016 № 03-04-05/30955).
При продаже «долевого» имущества единым объектом вычет распределяется между собственниками – об этом читайте «Как получить НДФЛ-вычет при продаже имущества в долевой собственности».