Документы, подписанные простой или усиленной неквалифицированной подписью, могут подтверждать расходы для целей бухучета и налога на прибыль. Но есть условие. Между вами и контрагентом должно быть заключено соглашение об электронном документообороте, а в нем прописан порядок проверки электронных подписей. Тогда вопросов к документам у налоговиков не возникнет (см. письмо ФНС от 19.05.2016 № СД-4-3/8904).
По вопросу подписания документов см. также «Первичкой с факсимиле нельзя подтвердить расходы».