Если вы подали уточненную декларацию с суммой налога к доплате, как положено, уплатив при этом пени, а впоследствии сдали еще одну уточненку, но уже с суммой налога к уменьшению, и инспекция с ней согласна, вы вправе потребовать возврата пеней. Ведь недоимка за тот период у вас отсутствует, а значит основания для уплаты пеней нет (Определение ВС РФ от 23.10.2014 № 305-КГ14-2599).

См. Образец заявления о возврате излишне уплаченный пеней.