Если заем вы погасили имуществом (отступным), включите его стоимость в базу по УСН. При предоставлении отступного происходит передача права собственности на вещь на возмездной основе. А значит, есть реализация (письмо Минфина от 28.06.2016 № 03-11-11/37751).
О других суммах, которые включаются в доходы, читайте:
А общие правила их учета при УСН ищите в статье «Какие доходы признаются (учитываются) при УСНО?».