Когда вы применяете УСН, уплачивать НДС в бюджет вы должны только в том случае, если выставляете счета-фактуры. При их отсутствии обязанность платить налог у вас не возникает, даже если в договоре цена указана «с НДС» и покупатель выделил налог в платежке. Так считает Минфин (письмо от 15.02.2018 № 03-07-14/9470).

Работа с или без НДС: плюсы и минусы рассмотрены в этой статье.