Доход свыше 300 000 рублей, с которого будете платить 1% в ПФР, считайте без учета расходов. Берите совокупный размер поступлений от реализации и внереализационных доходов (письмо Минфина от 29.04.2016 № 03-11-11/25395).

Больше о страховых платежах ИП узнайте из этой статьи.