Пункт 2 ст. 173 НК РФ ограничивает срок на возмещение НДС тремя годами по окончании квартала, в котором возникло право на вычет. Однако возместить налог вы можете и позднее – если докажете, что в срок не уложились по объективным причинам. Например, из-за незаконных действий налоговиков. Это вновь подтвердил КС РФ (см. Определение от 27.10.2015 № 2428-О). Признавать или нет причину уважительной – дело правоприменителей, как правило, суда.

Письмом от 24.12.2015 № СА-4-7/22683@ ФНС России направила данный вывод для использования в работе.

См. также «Что такое незаконное возмещение НДС и какая за это ответственность?».