Восстанавливать НДС по имуществу, утраченному в результате пожара, не нужно. Теперь это подтверждает ФНС РФ со ссылкой на арбитражную практику (Письмо ФНС России от 21.05.2015 № ГД-4-3/8627).

Подробнее о восстановлении НДС при выбытии имущества, не связанном с реализацией, см. «Следует ли восстановить НДС при выбытии основных средств и товарно-материальных ценностей в результате их списания, хищения, порчи, недостачи, потери, износа и т.п.?».