Главное условие включения в счет-фактуру неузаконенных реквизитов – сохранение его утвержденной формы. Поэтому размещать поля с дополнительной информацией следует после подписей руководителя и главбуха. Такое указание дал Минфин России в Письме от 24.11.2015 № 03-07-09/68169.

О форме счета-фактуры читайте в статье «Какие обязательные реквизиты у счета-фактуры в 2015 году?».

А о порядке его подписания – «Кто подписывает счет-фактуру (нюансы)?».