При расчете пропорции раздельного учета по НДС суммы процентов по предоставленным займам нужно учитывать в составе доходов от необлагаемых операций. На это указал ВС РФ в Определении от 29.06.2015 № 308-КГ15-6478.

Подробнее о пропорции см. «Какой порядок распределения входного НДС?».