Если по условиям договора аренды земельного участка арендатор компенсирует вам расходы на уплату земельного налога, включайте компенсацию в базу по НДС. Это ваша экономическая выгода, которая имеет прямое отношение к договору аренды и связана с его оплатой. А значит, облагается НДС. С этим соглашаются суды, включая ВС РФ (определение от 12.08.2016 № 305-КГ16-10312).

Верно определить НДС-базу вам поможет статья «Как определить налоговую базу по НДС (момент определения)?».