Этого делать не нужно. Компенсация за досрочное расторжение договора не связана с оплатой товаров, работ, услуг. А значит, не увеличивает базу по НДС. Это подтвердил Минфин (письмо от 19.10.2016 № 03-07-11/60859).

О другой не облагаемой по тому же основанию сумме см. «Штраф за просрочку оплаты не увеличивает НДС-базу продавца».