Если цена продажи товара ниже цены приобретения, а продавец и покупатель невзаимозависимы, НДС исчисляют из цены договора. При этом восстанавливать «входной» налог по проданному с убытком товару не требуется (Письмо Минфина России от 09.11.2015 № 03-07-11/64260).

Подробнее о случаях восстановления НДС читайте в статье «Ст. 170 НК РФ (2015): вопросы и ответы».