При оплате проезда работника к месту командировки и обратно в книге покупок регистрируйте бланки строгой отчетности или их копии с выделенной суммой НДС, выданные работнику и включенные им в отчет о командировке. Об этом напоминает Минфин России в Письме от 11.03.2015 № 03-07-11/12694.

См. также наш материал «Принимаем к вычету НДС по электронным авиабилетам».