Да, уплачивается.

Выдача молока «за вредность» – сугубо трудовой момент, обязанность работодателя, предусмотренная Трудовым кодексом и реализуемая в рамках трудовых отношений. Если получатель молока не является работником организации, то и освобождение от НДФЛ по ст. 217 НК РФ на него не действует.

На это указал Минфин (письмо от 16.01.2017 № 03-04-06/1220). Он рассматривал ситуацию с выдачей молока студенту-практиканту. Полагаем, что аналогичный вывод возможен также в отношении лиц, заключивших с организацией договор подряда. Он ведь тоже не подпадает по сферу, регулируемую ТК РФ.

Когда налог «на молоко» нужно удержать с работника, узнайте здесь.