Если после выездной проверки и оформления акта по ней вы подаете уточненную декларацию, в которой уменьшаете налог к уплате, инспекция вправе проверить этот период еще раз. Но только в измененной части. Данные, которые не изменялись, либо с корректировкой не связаны, контролеры трогать не должны. Это подтвердила ФНС (письмо от 26.09.2016 № ЕД-4-2/17979).

И обратите внимание, повторная проверка по данному основанию может проводиться за периоды, «старше» 3 лет. А поскольку налоги за такие периоды уже не возвращают, может и уточнять их не стоит?