При передаче имущества в уставный капитал другой организации вы должны восстановить НДС (пп. 1 п. 3 ст. 170 НК РФ). Новый владелец примет этот налог к вычету. Поэтому вы не можете взять его в расходы для налога на прибыль (Определение ВС РФ от 15.12.2014 № 305-КГ14-5030).